在蛋白质研究中，除了 N 端（氨基端）序列外，C 端（羧基端）序列同样具有重要的生物学信息。C 端蛋白测序是一种专注于解析蛋白质羧基末端氨基酸序列的技术，它能够揭示蛋白质成熟状态、翻译后修饰（PTMs）、降解模式以及蛋白质功能的关键线索。

一、C 端蛋白测序的概念

蛋白质是由氨基酸通过肽键连接形成的线性分子链，具有两个端点：

• N 端（氨基端）：通常是信号肽或起始氨基酸所在位置。
• C 端（羧基端）：蛋白质合成完成后的末端，可能带有多种翻译后修饰，如羧化、羟基化、羧基甲基化等。

C 端蛋白测序就是针对蛋白质的 C 端序列进行解析和表征的技术。C 端信息对于以下研究尤其重要：

• 蛋白质降解与半衰期研究（如泛素化、蛋白酶切）。
• 翻译后修饰（如羧基甲基化）分析。
• 蛋白质活性及功能的调控机制。

相比 N 端测序，C 端测序在技术上更具挑战，但提供了独特的功能信息，是全面解析蛋白质的重要补充。

二、C 端蛋白测序的发展历程

与 N 端测序起源于 Edman 降解类似，早期 C 端测序也基于化学方法，但因化学反应选择性和效率限制，解析长度有限。随着质谱技术的快速发展，现代 C 端测序主要依赖质谱（MS）方法，尤其是 LC-MS/MS 技术。通过特殊的酶解策略和标记技术，可以精准地识别 C 端氨基酸及其修饰，实现高灵敏、高通量分析。

三、C 端蛋白测序的主要方法

1、酶解+质谱策略

C 端蛋白测序的核心挑战在于如何从完整蛋白中获得 C 端肽段。常用策略包括：

（1）特异性酶切法

利用特定蛋白酶（如 Carboxypeptidase Y）从蛋白 C 端逐步切割氨基酸。每切除一个氨基酸，通过质谱分析肽段质量变化，推测 C 端序列。

（2）质谱直接分析

通过 LC-MS/MS 对蛋白酶解产物进行分析，利用数据库匹配识别 C 端肽段序列。可结合同位素标记（TMT/iTRAQ） 或 C 端特异性化学衍生，实现定量分析和修饰检测。这种方法的优势是能够同时获取多种信息：序列、翻译后修饰和肽段丰度，适用于复杂生物样本。

2、化学衍生法

早期 C 端测序方法依赖化学衍生反应，例如 Carboxypeptidase 反应结合高效液相色谱（HPLC）分析：

• 逐步切除 C 端氨基酸。
• 通过色谱检测衍生化的氨基酸。
• 循环进行序列推断。

尽管历史悠久，但该方法时间长、灵敏度低、对修饰敏感性有限，如今更多被质谱方法替代。

四、C 端蛋白测序的科研应用

1、蛋白质成熟与降解分析

蛋白质的 C 端信息可以反映蛋白质的成熟状态和降解模式。

• 蛋白酶切位点识别：C 端测序可用于确认蛋白质被特定蛋白酶切割的位置，帮助理解蛋白质加工机制。
• 泛素化与蛋白半衰期研究：泛素主要通过 C 端连接靶蛋白，解析 C 端序列可以追踪蛋白质降解信号。

C 端是许多关键修饰的富集区域，如羧基甲基化、羟基化和乙酰化。通过质谱结合 C 端特异性标记，科研人员可以精准识别 C 端修饰位点，研究修饰对蛋白质功能和信号通路的影响,在疾病相关蛋白分析中发现潜在标志物。

重组蛋白药物的 C 端一致性对药物活性和稳定性至关重要。

C 端蛋白测序是解析蛋白质羧基末端序列和修饰的关键技术，能够揭示蛋白质成熟状态、翻译后修饰及降解模式，对基础科研、药物开发和生物标志物研究都具有重要意义。现代质谱方法结合专门的酶切和标记策略，使 C 端测序更高效、灵敏，并可识别复杂修饰。百泰派克生物科技依托先进的质谱平台、丰富的蛋白质组学经验和专业的数据分析能力，为科研机构和企业提供高质量、定制化的 C 端测序服务，帮助客户深入理解蛋白质功能、优化药物研发及推动科研成果转化。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

>>点击了解更多优质服务项目